Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms