Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb7P09024 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms