Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms