Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P04212 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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