Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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