Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Clk2O35491 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clk2O35491 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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