Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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H2-Q1O19441 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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