Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EllO08856 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EllO08856 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
EllO08856 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
EllO08856 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
EllO08856 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
EllO08856 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
EllO08856 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
EllO08856 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
EllO08856 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
EllO08856 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms