Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MttpO08601 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MttpO08601 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms