Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms