Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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