Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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