Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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