Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Vmn1r34G3XA52 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms