Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SprtnG3X912 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms