Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M1F7CXU4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M1F7CXU4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M1F7CXU4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M1F7CXU4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M1F7CXU4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M1F7CXU4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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