Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc1E9Q043 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc1E9Q043 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc1E9Q043 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms