Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc8E9PWG2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms