Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms