Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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PtprfA2A8L5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms