Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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