Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phtf1Q9QZ09 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms