Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms