Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc4Q9ES56 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms