Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms