Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Chmp4cQ9D7F7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Chmp4cQ9D7F7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp4cQ9D7F7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4cQ9D7F7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms