Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms