Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc94Q9D6J3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms