Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc7Q9D541 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc7Q9D541 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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