Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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