Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem88Q9D0N8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms