Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms