Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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