Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms