Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntnap4Q99P47 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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