Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins4Q99LZ3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms