Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms