Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms