Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms