Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms