Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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