Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apol9aQ8VDU3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms