Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Fam20bQ8VCS3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Fam20bQ8VCS3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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