Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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