Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms