Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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