Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms