Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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