Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc17Q8CE13 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc17Q8CE13 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc17Q8CE13 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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