Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms